Pues todo dependerá del uso que le pretendas dar a esa bicicleta.
Por lo pronto, has de tener presente que un cuadro para rueda de 29" está pensado para equipar ruedas de ese tamaño, aunque eso no quiere decir que no se le puede equipar con unas ruedas algo más pequeñas, como unas 28"... pero unas ruedas de 26" creo que va a ser muy excesivo.
Si le fueras a montar una horquilla rígida, para hacer una bicicleta 100% rígida, es probable que no tuvieras problemas por incompatibilidad... siempre y cuando montaras unas bielas cortas, y la susodicha fueras a usarla solo por asfalto o pistas en buen estado.
El problema que yo veo es que vas a equipar ese cuadro con una horquilla amortiguada para rueda de 26", lo que significa que, en el momento en que dicha horquilla pueda alcanzar su máxima compresión, las bielas quedará peligrosamente cerca del suelo, y si ese momento clave te pilla con una de las dos bielas abajo del todo... una piedra, una raíz... un badén, un bordillo... podrá provocarte una de las caídas más duras que te puedas imaginar, pues la bicicleta te lanzará por los aires como si se tratase de una catapulta.
Yo no te recomiendo equipar un cuadro de 29" con horquilla y ruedas para 26"... pues es muy arriesgado.
Yo lo que haría sería comprar también una horquilla de 29", que al menos, en el momento de máxima compresión, siempre tendrá unos centímetros de más con respecto a una de 26".
Está claro que hacerte una bicicleta por piezas puede salir caro, y más aún si quieres pasar a una bicicleta para ruedas más grandes... cuadro + horquilla+llantas+neumáticos... es prácticamente una bicicleta.
De la 26", lo que podrás aprovechar sin problemas sería la trasmisión... quizás la tija ( si es para la medida del cuadro de 29" ), la potencia, la dirección ( si es compatible con el cuadro de 29" ), el manillar, los frenos ( si son de disco )... y alguna cosilla más, pero la horquilla y las ruedas... no te lo recomiendo... es mejor rascarse algo más el bolsillo y adquirir esos componentes... aunque sean de segunda pata, pues son los que te unen al suelo.
Por otro lado, y a pesar de que muy probablemente las bielas te sirvan para el cuadro de 29", otra cosa que tendrás que ver es si el eje de pedalier es también compatible con la caja de pedalier del nuevo cuadro.
por otro lado, las bielas que suelen equipar las bicicletas de 26" suelen ser algo más cortas que las que se usan en 29"... ( por la diferencia de altura libre al suelo ), lo que permite poder hacer mayor palanca, a la hora de pedalear... con ruedas de 29", necesitarás poder ejercen una buena palanca sobre el eje del pedalier, pues en cuestas suele ser la rueda que más lastra, de ahí que lo suyo es equipar mejor unas bielas largas.
Lo normal suele ser equipar ruedas de 26" en cuadros de 27.5", ya que hay muy poquita diferencia entre ambos tipos de rueda, por lo que apenas hay variación de geometría.
Lo normal sería equipar un cuadro de 29" con ruedas de 28", ya que, al fin y al cabo, una rueda de 28" no es más que una rueda de 29" pero con un neumático más pequeño.
Lo que no es normal es lo que pretendes, montar ruedas y horquilla de 26" en un cuadro de 29"... ¿ le montarías a tu bici de 26" ruedas de 20" o 24" ?...
Anímate que mañana también saldrá el Sol