Hola Aitor, bienvenido,
la zona de los Alpes Julianos eslovenos no la conozco pero por el resto sí que he pedaleado, concretamente los tramos: Ferrara-Padua-Venecia-Trieste, Gorizia-Ljubljanna-Zagreb y Módena-Padua-Venecia-Monfalcone-Trieste-Rijeka-Zadar-Split-Dubrovnik; respectivamente en 2003,2007 y 2008.
Toda la zona es muy recomendable y la costa croata es realmente hermosa (aunque un constante subeybaja y llena de curvas, así que las distancias sobre mapa son un poco engañosas, buen asfalto en general). Quizá las ciudades principales (Zadar, Split, Dubrovnik) se puede decir que tienen un centro histórico un tanto aseptizado y volcado en el turismo de masas, pero bueno...
No sé cómo tenéis pensado llegar a Venecia (¿avión?), de todos modos si que os desaconsejo totalmente entrar o incluso bordear la ciudad en bici, puede suponer del orden de veinte kilómetros por una intrincada red de autovías (muy señalizadas pero confusamente) con mucho tráfico. No olvidéis que Venecia-Mestre es un puerto importante y por eso el tráfico de camiones es abundante y muy agresivo.
Dado que el aeropuerto (como veréis en algún mapa) está al este de Venecia, en la carretera que va hacia Portogruaro y Trieste, creo que lo mejor sería buscar un cámping cerca del aeropuerto y de allí moverse en bus o barco a visitar Venecia (pese al turismo merece la pena). Todos los cámpings de la zona suelen estar bien comunicados con la ciudad (aunque todo sea por allí escandalosamente caro).
Así estaríais ya enfilados hacia el este. No sé vuestro itinerario exacto pero, por la parte que conozco, entre Venecia y Trieste tenéis bastantes cámpings, aunque la carretera principal va por el interior y los cámpings están en la costa (por ejemplo en Caorle), lo que supone, a veces, desvíos de hasta treinta kilómetros. En toda esta zona es imprescindible llevar algún buen repelente de insectos, la región está llena de humedales y completamente infestada de mosquitos (entre ellos el famoso tigre que entró a Europa por aquí).
En Trieste hay un cámping en las alturas de Opicina, en un pinar en la montaña desde la que hay unas vistas estupendas de la ciudad y la bahía, comunicado con ésta con bus urbano y un precioso funicular antiguo que merece la pena probar. Para salir de Trieste es preferible evitar la salida por la costa (otra trampa de autovías y túneles) y tirar unos kilómetros hacia el interior, a alguno de los diversos pasos fronterizos de las montañas del Karst, para luego regresar a la costa.
En la costa croata encontraréis cámpings, aunque menos de lo deseable, baratos pero bastante sencillos en general. En Zadar, Split y Dubrovnik hay también albergues (hostels).
¡Ah! una pequeña cuestión acerca del bora, el viento que sopla por esa zona del Adriático en ocasiones. En el 2007 me pilló un día con ráfagas de hasta 140 km/h según supe después. He leído que a la altura de Rijeka llega a veces hasta los 220 km/h. En esos casos no se puede hacer nada, refugiarse y esperar o bien acortar camino en bus o tren si hay suerte. ¡Bueno, no quiero asustaros tampoco! ¡seguro que no tenéis ni una ligera brisa!
En cuanto a lo del material y el carrito o alforjas, si buscas en los archivos de rodadas algunos completísimos post de Avo y Ali, o en estos mismos foros (recuerdo que estaba el hilo que precisamente mencionabas sobre las respectivas ventajas e inconvenientes de carrito y alforjas) seguro que tendrás tanta información como necesites para decidirte por una u otra opción. Por mi parte siempre he viajado con alforjas, pero como no he probado nunca un carro prefiero no pronunciarme.
Corto ya por no alargarme más pero si quieres algo más de información, o incluso cosas ya en detalle (direcciones, estado de las carreteras en unas zonas u otras...), dímelo y será un placer poder compartir experiencias y que sirvan a otros.
Saludos.
Aitor 
Delaire